当有机污染物经过紫外线照射区域时，紫外线会穿透生物的细胞膜和细胞核，破坏DNA的分子键，使其失去复制能力或失去活性。因此细胞不能复制，微生物不久就会死亡。
循环风紫外线消毒设备对经过其照射范围内的微生物产生累加的影响，也就是说，对**次经过紫外线照射区域没有被杀死的微生物，在随后的循环中将会被杀死。
紫外线会破坏生物的再生能力，这点是非常重要的。因为一个细菌在24小时内会繁殖成百上千甚至上百万细菌，这也意味着即使*有效的空气过滤器也不能完全去除微生物，所以利用紫外线灭菌是治本之道。一种微生物被紫外线杀灭所需要的剂量取决于紫外光强度和照射时间。
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