对比传统养殖模式，工厂化循环水养殖具有以下优点：1、不受气候影响进入21世纪以来，由于人类对自然资源的过度利用，全球气候异常情况频发。台风，干旱，洪涝等极端天气多发，对养殖户造成了不可估量的影响，传统网箱养殖以及土塘养殖损失惨重。往往一场暴雨就可能导致土塘水质剧烈变化，养殖品逃脱等严重后果。相比之下，工厂化水产养殖采用的是工厂、大棚等室内养殖模式，基本不受极端天气和气候的影响，增强了养殖系统的稳定性，降低了养殖风险。
2、节约用水水资源是地球最宝贵的资源，随着人类社会的发展，水资源被过度消耗，水质恶化，水资源日益枯竭等情况屡见不鲜。作为对水资源严重依赖的水产养殖行业，如何节约用水一直是水产养殖行业的当务之急。工厂化循环水养殖系统通过对养殖废水的处理和循环再利用，大大降低了水资源的消耗，使水资源的利用率达到了98%以上。同时工厂化循环水养殖几乎不向外排污，保护了环境，为可持续发展水产养殖奠定了坚实的技术基础。
3、绿色环保传统土塘和网箱养殖因为与外界环境相连通，存在着大量的病害侵扰。特别是网箱养殖，当一片水域被感染后，很容易造成周围水域相继被感染，使得整个养殖区域面临巨大的病害风险。当遇到病害侵袭时，养殖户不得不大量用药以保证养殖品种的存活率，这也进一步导致了水体污染，养殖品种药物残留超标，不仅降低了养殖品种的价值，也容易引起食品安全等一系列问题。工厂化循环水养殖中所有的养殖池均被隔离开，当一个养殖池被感染后，其它养殖池可不受影响。而且工厂化养殖系统中的养殖水保持24小时循环状态，水质良好，养殖品种在良好的水质环境中，体质有保障，远离病害，基本无需投药，环保安全。4、高密度高收益工厂化循环水养殖技术的*核心优势就是高密度养殖。以宝石鲈为例，养殖密度可达60kg/m，而传统养殖密度仅为亩产2000kg，约合3kg/m。同样的产量，工厂化循环水养殖仅需传统养殖面积的5%左右，节水节地。高密度养殖也带来了高收益，亩产收益为传统养殖模式的几十倍以上。
4、人力成本低工厂化循水养殖普遍采用集约化和机械化，自动化操作，大大节省了人力，降低了人力成本。
尽管工厂化水产养殖具有以上优点，但是它并不能靠简单的设备安装就能实现。仍然需要人和系统的配合，它是一个系统工程，如何将有限的资源发挥*的经济效益，人是其中的关键。面对工厂化循环水养殖，我们需要用科学的态度去看待它，用系统的方法去操作他，才能在实际养殖过程中不管提高效益，创造更好的价值。