1)使用了LysisDye,菌体裂解是否完全一目了然。由于判断菌体裂解和中和是否彻底更主要取决于操作者的经验,所以我们增加了LysisDye(一种能使裂解/中和体系变换颜色的试剂)来帮助观察裂解/中和的程度。加入P1后,LysisDye使菌液变为浑浊的红色;加入P2后,LysisDye立即使溶液变为澄清的红色,裂解是否完全只要观察红色溶液是否澄清,如果红色非常均一,表明裂解充分;在完全裂解的体系中加入P3混匀后,体系立即变为黄色,任何红色的残留表明没有完全混匀或者中和不彻底。
2 )增加了去蛋白液PD,能更加彻底地去除蛋白污染,得到纯度更高的质粒。
准备工作1. 将试剂盒附带的RNase A全部加入到溶液P1中(如15ml P1中加入150μl RNase A),混匀后4℃贮存。
2. 按照标签所示在漂洗液PW中加入无水乙醇,混匀后盖紧瓶盖后室温贮存备用。
3. 每次使用前请检查溶液P2,溶液P3和去蛋白液PD是否有沉淀生成,如果出现沉淀,37℃温浴至沉淀溶解后再使用。
使用说明使用LysisDye的标准操作步骤:
如非指出,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
1. 取1–5 ml过夜培养的菌液加入离心管中,10,000g 离心1分钟,尽量吸除上清。注:菌液较多时可以通过几次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中。
2. 向菌体沉淀的离心管中加入250 μl溶液P1(请先检查是否已加入RNaseA)和5μlLysisDye,使用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌细胞沉淀,此时溶液为浑浊的红色。注:如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
3. 加入250 μl溶液P2,温和地上下翻转6–8次使菌体充分裂解,此时溶液变为澄清的红色。注:温和地混合,不要剧烈震荡,以免污染基因组DNA;所用时间**不应超过5分钟,以免质粒受到破坏;红色溶液应该透明均一,如有浑浊红色颗粒,表明裂解不充分,会大大降低质粒提取效率。
4.加入350μl溶液P3,立即温和地上下翻转,充分混匀,混匀充分的标志是溶液完全呈透明的黄色,如有可见红色,说明混匀不彻底。10,000g离心10分钟。注:P3加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。
5.小心地将上清转移到吸附柱CP中(吸附柱放入收集管中),10,000g离心30–60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP重新放回收集管中。
6. 向吸附柱CP中加入500 μl去蛋白液PD,10,000g离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP重新放回收集管中。
7. 向吸附柱CP中加入700μl漂洗液PW(请先检查是否已加入无水乙醇),10,000g离心30–60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP重新放回收集管中。
8. 向吸附柱CP中加入500 μl漂洗液PW,10,000g 离心30–60秒,倒掉收集管中的废液。
9. 将吸附柱CP置于重新放回收集管中,10,000g 离心2分钟。注:此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,**不可省略,因为漂洗液中乙醇的残留会影响后续实验(酶切,PCR等)。
10.将吸附柱CP置于一个干净的1.5ml离心管中,向吸附膜的中央部位悬空滴加50–100μl洗脱缓冲液EB,室温放置2分钟,10,000g离心2分钟将质粒溶液收集到离心管中,-20℃保存。
【注】
● 为了增加质粒的回收效率,可将得到的洗脱液重新加入离心吸附柱中,再次离心收集。
● 洗脱缓冲液体积不应少于50 μl,体积过小影响回收效率。
● 洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。
不使用LysisDye的标准操作步骤:
如非指出,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
1. 取1–5 ml过夜培养的菌液加入离心管中,10,000 g离心1分钟,尽量吸除上清。注:菌液较多时可以通过几次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中。
2.向菌体沉淀的离心管中加入250μl溶液P1(请先检查是否已加入RNaseA),使用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌细胞沉淀。注:如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
3. 加入250 μl溶液P2,温和地上下翻转6–8次使菌体充分裂解。注:温和地混合,不要剧烈震荡,以免污染基因组DNA;所用时间**不应超过5分钟,以免质粒受到破坏。
4. 加入350μl溶液P3,立即温和地上下翻转6–8次,充分混匀,此时会出现白色絮状沉淀。10,000g离心10分钟。注:P3加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
5.小心地将上清转移到吸附柱CP中(吸附柱放入收集管中),10,000g离心30–60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP重新放回收集管中。
6. 向吸附柱CP中加入500 μl去蛋白液PD,10,000g离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP重新放回收集管中。
7. 向吸附柱CP中加入700μl漂洗液PW(请先检查是否已加入无水乙醇),10,000g离心30–60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP重新放回收集管中。
8. 向吸附柱CP中加入500 μl漂洗液PW,10,000g 离心30–60秒,倒掉收集管中的废液。
9. 将吸附柱CP置于收集管中,10,000g 离心2分钟。注:此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,**不可省略,因为漂洗液中乙醇的残留会影响后续实验(酶切,PCR等)。
10.将吸附柱CP置于一个干净的1.5ml离心管中,向吸附膜的中央部位悬空滴加50–100μl洗脱缓冲液EB,室温放置2分钟,10,000g离心2分钟将质粒溶液收集到离心管中,-20℃保存。
【注】
● 为了增加质粒的回收效率,可将得到的洗脱液重新加入离心吸附柱中,再次离心收集。
● 洗脱缓冲液体积不应少于50 μl,体积过小影响回收效率。
● 洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。
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